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张小明 2026/1/1 19:47:13
北京网站开发公司电话,最新最好玩的网页游戏排行榜,wordpress 类似,网站是生成静态好还是动态好本文探讨了知识图谱与大语言模型在药物发现领域的整合应用。通过三种整合框架#xff0c;结合两者优势#xff0c;解决了LLMs的幻觉和语义理解不足问题#xff0c;显著提升了靶点识别、药物相互作用预测等关键环节的效率。知识图谱提供结构化数据和语义关系#xff0c;大语…本文探讨了知识图谱与大语言模型在药物发现领域的整合应用。通过三种整合框架结合两者优势解决了LLMs的幻觉和语义理解不足问题显著提升了靶点识别、药物相互作用预测等关键环节的效率。知识图谱提供结构化数据和语义关系大语言模型提供自然语言处理能力为生物医药研究带来全新机遇代表药物发现领域的技术飞跃。Integrating Knowledge Graphs and Large Language Models for Next-Generation Drug Discovery摘要本文探讨了知识图谱KG和大语言模型LLM在生物医药研究中的整合应用及其对药物发现的革命性影响。通过结合语义分析和人工智能技术这些工具正在优化目标识别、药物相互作用预测及药物重定位等关键流程为生命科学研究带来全新机遇。正文一、引言药物发现的新时代在生物医药研究领域技术的快速进步正在重塑药物发现与开发的传统模式。知识图谱Knowledge Graphs, KG和大语言模型Large Language Models, LLMs作为两种强大的工具近年来在该领域崭露头角。知识图谱通过结构化数据捕捉生物医学中的复杂关系而大语言模型则以其强大的自然语言处理能力在文献挖掘和假设生成中发挥重要作用。本文将深入探讨这两种技术的整合如何推动下一代药物发现以及它们在解决生物医药领域关键挑战中的潜力。近年来BioStrand 公司在其博客中详细阐述了这两种技术的结合如何为药物研发带来突破。本文基于其内容改写旨在为专业读者、科研人员及投资人提供全面的视角帮助其理解这一技术趋势的商业和科学价值。二、知识图谱与大语言模型在生物医药研究中的角色1. 大语言模型LLMs的潜力与局限大语言模型LLMs是建立在海量文本数据上的自然语言处理工具其在生物医药领域的应用已显示出超越传统工具的表现。特别是经过领域特定预训练的生物医药LLMs能够在诸如生物实体识别BioNER和关系抽取等任务中表现出色。然而尽管潜力巨大LLMs 仍面临一些关键挑战例如“幻觉”hallucination即生成不准确或无根据的内容以及解释性不足的问题。更重要的是LLMs 缺乏语义智能。一些研究者将其戏称为“随机鹦鹉”stochastic parrots认为其仅通过统计相关性“学习”语言而未能真正理解语言的含义。这种局限在生物医药领域尤为突出因为该领域的词汇和概念具有高度复杂性和上下文依赖性。2. 知识图谱KG的语义优势与LLMs 不同知识图谱通过强调实体间的定义和语义关系弥补了LLMs 在语义理解上的不足。知识图谱能够捕捉生物医学数据的固有图结构例如药物与疾病的交互、蛋白质与蛋白质的关系等并将异构数据整合成一个统一且可计算的框架。这种结构不仅对人类易于理解也便于计算机处理。知识图谱利用特定领域的本体论ontologies正式定义各种概念和关系从而基于上下文丰富和关联数据。这种语义能力使其成为生物医药研究中不可或缺的工具尤其是在需要从复杂数据中提取知识的场景下。三、知识图谱与大语言模型的整合框架为了充分发挥两者的优势研究者提出了三种整合知识图谱与LLMs 的框架以推动药物发现和开发。1. 知识图谱增强的LLMs第一种框架侧重于利用知识图谱的显式结构化知识在预训练、推理和解释性等不同阶段增强LLMs 的能力。这一方法具有三大优势提升知识表达通过知识图谱的结构化数据例如基因、蛋白质、疾病、化学化合物等LLMs 能够更准确地表达领域知识。提供最新知识知识图谱能够持续更新为LLMs 提供最新的信息支持。增强透明度知识图谱为“黑箱”语言模型的推理过程提供更多可解释性。通过结合知识图谱的结构化数据和科学文献、临床试验报告等非结构化数据这一框架为药物发现提供了更全面的领域视角。2. LLM 增强的知识图谱第二种框架利用LLMs 的自然语言处理能力来优化知识图谱的构建和应用。LLMs 可以加速图谱构建、支持图到文本生成graph-to-text generation以及增强问答系统的性能。这种方法结合了LLMs 的语言能力和知识图谱的语义关系为药物研究人员提供更快、更精准的复杂问题解答并基于模式和相关性提取洞见。此外LLMs 还可以通过不断提取和丰富药物知识图谱提升其在药物发现中的实用性。3. 协同生物医药LLM与知识图谱模型第三种框架旨在创建一个双向数据和知识推理的协同模型结合生成能力和推理能力。目前这一方法的开发主要集中于特定任务但未来有望扩展到更广泛的下游应用。这种协同模型代表了知识图谱和LLMs 整合的最终方向将显著提升药物发现和开发的效率。四、药物发现中的具体应用知识图谱和LLMs 的整合已经在药物发现和开发的多个环节中产生变革性影响。以下是几个关键应用场景1. 靶点识别Target Identification靶点识别是药物发现的关键步骤对后续开发流程具有深远影响。AI 驱动的LLMs 在生物医学命名实体识别BioNER和关系抽取等任务中表现出色超越了传统方法。基于Transformer 的LLMs 在化学信息学中被用于推进药物-靶点关系预测并生成新颖、有效且独特的分子结构。此外多模态大语言模型MLLMs通过图像与文本的自适应学习进一步提升了靶点识别和验证的效率。知识图谱则通过将异构数据整合到一个互联框架中增强了靶点识别的效率使研究人员能够更全面地探索和分析数据。2. 药物-靶点相互作用DTI和药物-药物相互作用预测AI 驱动的LLMs 越来越多地被用于预测药物-目标相互作用DTI、药物-药物相互作用以及药物的药代动力学、药效学和毒性等分子特性。它们甚至可以预测由于安全问题可能导致的药物撤市风险。知识图谱则在多药物预测、DTI 预测、不良反应ADR预测、基因-疾病优先级排序以及药物重定位等任务中发挥了重要作用。3. 检索增强生成RAG在药物发现中的应用检索增强生成RAG是一种结合LLMs 与内部和外部可信数据源的方法。在药物发现中RAG 通过访问生物医学数据集或专有数据帮助生成科学依据充分的回答。当与知识图谱结合时RAG 可以支持上下文感知的候选建议、文献总结甚至基于实验输入生成假设。这在数据碎片化的生物医学领域尤为有用能够揭示跨模态关系如组学层、路径、表型等。五、优化生物医药研究的挑战与解决方案尽管LLMs 和知识图谱的整合潜力巨大但在将其广泛应用于生物医药研究之前仍需解决三大挑战知识截止knowledge cut-off、幻觉hallucinations和解释性interpretability。为此研究者提出了两种互补方法1. 利用知识图谱增强事实准确性第一种方法是利用知识图谱中结构化、事实性、领域特定的知识增强LLMs 的事实准确性、一致性和透明度。通过基于图的查询语言可以直接查询和整合知识图谱中的预结构化数据到LLMs 中。2. 结合外部信息检索另一种关键能力是让生物医药LLMs 能够按需从外部来源检索信息以生成最新且与上下文相关的回答。这在生物医药研究中至关重要原因有二确保LLMs 的内部知识得到来自领域特定、高质量、可更新知识来源的补充。提供数据来源以便检查回答的准确性和出处。RAG 方法通过结合外部知识检索机制和LLMs 的能力显著提升了生物医药LLMs 的推理、准确性和知识召回能力。结合知识图谱和基于RAG 的方法将在事实准确性、上下文感知和持续知识丰富方面带来显著改进。六、LLMs 与蛋白质语言模型PLMs的区别与协同在药物发现中除了LLMs 外蛋白质语言模型PLMs也发挥着重要作用。LLMs 是通用模型擅长处理文本数据可用于文献挖掘或临床试验设计而PLMs 则是基于生物序列如氨基酸训练的模型用于捕捉蛋白质的结构和功能洞见。两者结合能够实现跨模态推理为更智能的药物发现提供支持。例如一个由PLM 预测的蛋白质结构可以通过生物医学知识图谱链接到路径洞见而LLM 则可以解读这些连接提出可能的疾病关联或治疗假设并通过RAG 检索支持性文献。这种多层整合类似于专家科学家的推理方式帮助团队更快地筛选和优先考虑有意义的候选药物。七、LENS ai下一代RAG-KG-LLM平台BioStrand 公司已成功开发了下一代统一知识图谱-大语言模型框架其核心是 LENS ai 平台。该平台包含一个全面且持续扩展的知识图谱映射了整个生物圈中 250 亿个关系和 6.6 亿个数据对象链接了序列、结构、功能和文献信息。这种技术为基因、蛋白质和生物路径之间的关系提供了整体理解开辟了药物发现和开发的新机会。LENS ai 平台利用本体驱动的自然语言处理NLP和AI驱动的LLMs将语法多模态序列和结构数据和语义功能连接和关联起来。其统一方法结合了LLMs 的推理能力、知识图谱的语义能力以及RAG 的信息检索能力简化了生物医学数据的整合、探索和分析。八、未来展望知识图谱与大语言模型的整合代表了药物发现领域的一次重大技术飞跃。随着研究的深入和协同模型的扩展这些技术将在更广泛的应用中发挥作用推动药物研发效率和成功率的显著提升。对于科研机构和投资人而言理解和参与这一趋势将带来重要的战略优势。目前BioStrand 等公司已在这一领域取得初步成功但未来仍需更多跨学科合作和资源投入以解决现有挑战并加速技术落地。​最后我在一线科技企业深耕十二载见证过太多因技术卡位而跃迁的案例。那些率先拥抱 AI 的同事早已在效率与薪资上形成代际优势我意识到有很多经验和知识值得分享给大家也可以通过我们的能力和经验解答大家在大模型的学习中的很多困惑。我整理出这套 AI 大模型突围资料包✅AI大模型学习路线图✅Agent行业报告✅100集大模型视频教程✅大模型书籍PDF✅DeepSeek教程✅AI产品经理入门资料完整的大模型学习和面试资料已经上传带到CSDN的官方了有需要的朋友可以扫描下方二维码免费领取【保证100%免费】​​为什么说现在普通人就业/升职加薪的首选是AI大模型人工智能技术的爆发式增长正以不可逆转之势重塑就业市场版图。从DeepSeek等国产大模型引发的科技圈热议到全国两会关于AI产业发展的政策聚焦再到招聘会上排起的长队AI的热度已从技术领域渗透到就业市场的每一个角落。智联招聘的最新数据给出了最直观的印证2025年2月AI领域求职人数同比增幅突破200%远超其他行业平均水平整个人工智能行业的求职增速达到33.4%位居各行业榜首其中人工智能工程师岗位的求职热度更是飙升69.6%。AI产业的快速扩张也让人才供需矛盾愈发突出。麦肯锡报告明确预测到2030年中国AI专业人才需求将达600万人人才缺口可能高达400万人这一缺口不仅存在于核心技术领域更蔓延至产业应用的各个环节。​​资料包有什么①从入门到精通的全套视频教程⑤⑥包含提示词工程、RAG、Agent等技术点② AI大模型学习路线图还有视频解说全过程AI大模型学习路线③学习电子书籍和技术文档市面上的大模型书籍确实太多了这些是我精选出来的④各大厂大模型面试题目详解⑤ 这些资料真的有用吗?这份资料由我和鲁为民博士共同整理鲁为民博士先后获得了北京清华大学学士和美国加州理工学院博士学位在包括IEEE Transactions等学术期刊和诸多国际会议上发表了超过50篇学术论文、取得了多项美国和中国发明专利同时还斩获了吴文俊人工智能科学技术奖。目前我正在和鲁博士共同进行人工智能的研究。所有的视频教程由智泊AI老师录制且资料与智泊AI共享相互补充。这份学习大礼包应该算是现在最全面的大模型学习资料了。资料内容涵盖了从入门到进阶的各类视频教程和实战项目无论你是小白还是有些技术基础的这份资料都绝对能帮助你提升薪资待遇转行大模型岗位。智泊AI始终秉持着“让每个人平等享受到优质教育资源”的育人理念‌通过动态追踪大模型开发、数据标注伦理等前沿技术趋势‌构建起前沿课程智能实训精准就业的高效培养体系。课堂上不光教理论还带着学员做了十多个真实项目。学员要亲自上手搞数据清洗、模型调优这些硬核操作把课本知识变成真本事‌​​​​如果说你是以下人群中的其中一类都可以来智泊AI学习人工智能找到高薪工作一次小小的“投资”换来的是终身受益应届毕业生‌无工作经验但想要系统学习AI大模型技术期待通过实战项目掌握核心技术。零基础转型‌非技术背景但关注AI应用场景计划通过低代码工具实现“AI行业”跨界‌。业务赋能 ‌突破瓶颈传统开发者Java/前端等学习Transformer架构与LangChain框架向AI全栈工程师转型‌。获取方式有需要的小伙伴可以保存图片到wx扫描二v码免费领取【保证100%免费】**​
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